Hotta Masayoshi là con trai nhỏ của daimyō đời thứ 3 phiên Sakura, Hotta Masatoki, và được sinh ra tại dinh thự Edo của phiên. Sau cái chết của cha mình vào năm 1811, ông được anh trai của mình, daimyo đời thứ tư của phiên Sakura, Hotta Masachika, nhận nuôi để đảm bảo quyền kế vị gia tộc. Masachika có thân hình ốm yếu và đến năm 1824, dòng dõi cấp cao của gia tộc Hotta đã có một phong trào đòi loại bỏ ông và thay thế bằng con trai của Hotta Masatsu, daimyo phiên Katada và đang giữ chức wakadoshiyori trong Mạc phủ. Điều này đã bị phản đối mạnh mẽ bởi hầu hết giới chức chủ chốt trong phiên Sakura, và Hotta Masayoshi được phong làm daimyo. Gần như ngay lập tức, khu vực này phải hứng chịu gánh nặng thuế má về mặt tài chính trong việc cải thiện khả năng phòng thủ ven biển ở vịnh Edo trước sự xâm nhập của đoàn tàu đen. Tuy nhiên, Masayoshi đã chứng tỏ là một nhà quản lý tài năng, tiến hành cải cách tài chính của phiên, tài trợ cho các nghiên cứu về rangaku, đặc biệt là khoa học quân sự phương Tây và thành lập ngôi trường tiền thân của Đại học Juntendo.